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胶质瘤的瘤内异质性使其能够适应具有挑战性的微环境,并促成了治疗的耐药。有鉴于此,美国杰克逊基因医学实验室的Roel G. W. Verhaak、Kevin C. Johnson等研究人员,通过单细胞多模式胶质瘤分析确定细胞可塑性和环境应激反应的表观遗传调节因子。

本文要点

1研究人员整合了11个成年IDH突变型或IDH野生型胶质瘤的914个单细胞DNA甲基化组、55284个单细胞转录组和大量多组学资料,用于划定瘤内异质性的来源。

2结果表明,局部DNA甲基化紊乱与细胞-细胞DNA甲基化差异有关,在更具侵略性的肿瘤中升高,与转录破坏有关,并在环境应激反应期间发生改变。

3胶质瘤细胞在体外缺氧和辐照压力下,局部DNA甲基化紊乱增加,细胞状态发生转变。

4研究人员确定了遗传和表观遗传不稳定之间的正相关,这在大量纵向收集的DNA甲基化数据中得到了支持。

5DNA甲基化紊乱的增加与疾病的加速发展有关,反复选择的DNA甲基化变化富含环境压力反应途径。

本文研究工作确定了一个表观遗传促进的适应性应激反应过程,并强调了表观遗传异质性在塑造治疗结果中的重要性。

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参考文献:

Kevin C. Johnson, et al. Single-cell multimodal glioma analyses identify epigenetic regulators of cellular plasticity and environmental stress response. Nature Genetics, 2021.

DOI:10.1038/s41588-021-00926-8

https://www.nature.com/articles/s41588-021-00926-8

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